identifier: Pellerin, Charles  (1994). Comparaison génomique de souches du virus de la diarrhée virale bovine- A) Région codant pour la p125- B) Région 5' non-codante  Mémoire.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en virologie et immunologie, 224 p.

abstract:
 En se basant sur leur effet en culture cellulaire, les souches du virus de la diarrhée virale bovine (BVDV) peuvent être divisées en deux biotypes: cytopathogène(CP) et non-cytopathogène (NCP). L'importance de cette distinction se situe au niveau de la pathogénèse de la maladie des muqueuses (MD), une maladie fatale pour l'animal atteint. En effet, le passage d'une souche NCP en souche CP est à l'origine de la MD. Jusqu'à présent, le seul moyen moléculaire de différencier une souche NCP d'une souche CP est la présence, chez cette dernière, d'une protéine de 80 kDa (p80) contrairement aux souches NCP qui ne produisent que la p125, le précurseur de la p80. Jusqu'à maintenant, les souches CP étudiées au niveau des séquences de la p125 ont révélé divers réarrangements conduisant à la production de la p80. Toutefois, certaines souches CP ne semblent pas contenir de réarrangements génomiques importants au niveau du gène codant pour la p125. Ainsi, des mutations ponctuelles au niveau de la p125, ou encore des réarrangements mineurs (délétions et/ou insertions) imperceptibles sans l'analyse détaillée du génome, pourraient potentiellement expliquer l'origine de la p80 chez ces souches.

 Dans la première partie du projet, la région codant pour la p125 (p54/p80) de deux de ces souches CP intéressantes (Singer et Oregon) et de deux souches NCP(Draper et NY -1) fut amplifiée au moyen de la réaction de polymérase en chaîne (PCR), clonée et séquencée. La séquence en acides aminés de la p125 fut ensuite déduite. Mis à part l'insertion connue de 4 acides aminés retrouvée chez la souche NY -1, aucune déletion ou insertion ne fut rencontrée au niveau de la région amplifiée des autres souches. Cependant, en considérant chacun des résidus d'acides aminés un à un, six différencient les souches Oregon et Singer des souches NCP. Tous ces résidus particuliers se situent au niveau de la portion de la p125 correspondant à la p54. Ceci
suggère donc que l'activité protéase de la p80, qui pourrait être responsable du clivage de la p125 en p54 et p80, n'est pas modifiée directement chez les souches CP ne possédant aucun réarrangement. Par contre, il est possible qu'une modification de la p54, ou celle d'un cofacteur hypothétique de la p80, entraîne le clivage de la p125. Du côté de la p54, il est difficile d'attribuer avec certitude une importance quelconque aux six substitutions spécifiques notées car (i) aucun rôle ou domaine de la p54 n'est encore démontré expérimentalement et (ii) beaucoup d'autres mutations sont rencontrées au niveau de la p54; ces mutations ne différencient pas spécifiquement les souches Oregon et Singer des souches NCP, mais pourraient être aussi importantes.

 D'autre part, l'analyse des séquences nucléotidiques de la p125 des différentes souches permet de confirmer, sur un plus grand nombre de souches, que la région codant pour la p54 est une région très variable contrairement à celle codant pour la p80. Il a été également possible de discerner deux groupes génomiques de BVDV: le groupe la(incluant les souches NADL, Singer, Oregon et SD-1) et le groupe lb (incluant les souches Osloss, Draper et NY-1). Au niveau de la région codant pour la p54, l'homologie moyenne entre les souches des deux groupes est de 77.3% tandis qu'entre les souches d'un même groupe, elle est de 88.0% (la) et de 91.6% (lb).

 Dans la seconde partie du projet, des nouvelles souches de BVDV ayant causé un taux élevé de mortalité associé à des épidémies au Québec en 1993 ont été identifiées. Ces souches furent caractérisées au niveau de la région 5' non-codante (S'UTR) de leur génome. La comparaison des séquences obtenues avec celle des souches de BVDV classiques démontrent clairement que les souches épidémiques forment un groupe distinct de BVDV. En effet, l'homologie moyenne entre les souches classiques (groupe 1) et les souches épidémiques (groupe II) est inférieure à 75%, tandis qu'elle est supérieure à 90% entre les souches d'un même groupe. Dans le cas du groupe 1, il est possible de subdiviser les souches en deux sous-groupes (la et lb). Les souches membres de l'un ou l' autre de ces sous-groupes sont aussi membres du même sous-groupe quant à leur séquence au niveau de la région codant pour la p125. Ainsi, les groupes la, lb et II pourraient bien représenter la vraie classification génomique des souches du BVDV.

 Deng et Brock (1993) ont suggéré que la 5'UTR du BVDV représenterait un site interne d'entrée des ribosomes permettant l'initiation de la traduction par un mécanisme indépendant de la coiffe. Comme les structures secondaires de la 5'UTR seraient essentielles pour assurer ce rôle, nous avons regardé si elles ne pouvaient pas être modifiées chez les souches du groupe II étant donné la différence de 25% qui existe au niveau des séquences de leur 5'UTR par rapport à celle du groupe 1. L'analyse a démontré que les structures secondaires étaient très bien conservées autant dans un groupe que dans l'autre. Ceci indique la présence d'une forte pression évolutive dans le but de maintenir les structures secondaires et suggère l'importance majeure de la 5'UTR dans le cycle du BVDV. Toutefois, si les structures secondaires sont d'apparences similaires entre les deux groupes, la stabilité de ces structures ne l'est pas. En effet, les structures des souches du groupe II sont en moyenne beaucoup plus stables que celles du groupe 1. Cette stabilité accrue et/ou les différences nucléotidiques pourraient avoir un lien avec la virulence marquée des souches épidémiques.


identifier: N'Diaye, Maïmouna  (1995). Caractérisation d'un variant antigénique du virus influenza porcin type A (H1N1) associé à la pneumonie proliférative et nécrosante  Mémoire.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en virologie et immunologie, 218 p.

type:
Thèse
Non évalué par les pairs

abstract:
Au Québec en 1990, un nouveau variant du virus influenza
de type A (H1N1) porcin a été isolé d'animaux affectées par des problèmes respiratoires attribuables à des lésions de pneumonie proliférative et nécrosante (PPN). Les études sérologiques comparatives réalisées avec le test d'inhibition de l'hémagglutination (IHA) n'ont démontré aucune réactivité de ce nouvel isolat envers différents sérums hyperimmuns dirigés contre des souches de virus d'influenza humains de type A (H1N1, H2N2, H3N2), B et c. De plus, ce nouvel isolat québécois s'est avéré antigéniquement apparenté mais distinct des souches porcines québécoises et américaines de référence, A/SwinejQuébec/192/81(H1N1) (QC81) et A/SwinejNew Jerseyf8/76(H1N1), et celles communément associées aux épidémies de grippe classique survenues au Québec avant cette période. L'étude des variations antigéniques de ce nouveau variant a été effectuée. L' objectif était de produire des anticorps monoclonaux (AcMo) dirigés spécifiquement contre l'hémagglutinine(HA) de la nouvelle souche A/SwinejQuébecf5393/91(H1N1)(QC91) afin d'établir les paramètres pour la mise au point d'une épreuve ELISA de blocage permettant la distinction entre les anticorps produits chez le porc contre les souches associées à des lésions de PPN et la souche de référence(QC81). Par ailleurs, les relations antigéniques et génétiques existant entre la souche QC91 et les autres isolats québécois associés à des lésions de PPN ont été évaluées de même que
l'évolution antigénique et génétique des souches du virus de
l'influenza porcin A(H1N1) circulant dans la population porcine au Québec de 1981 à 1990. Des AcMo ont été obtenus suite à l'immunisation de souris BALB/c avec les préparations de virus QC91 dissocié à l'éthertween 20. Six AcMo appartenant tous à la sous classe d'immunoglobulines IgG1 et spécifiques à la protéine HA de la souche QC91 ont été obtenus. Un AcMo désigné G9 a été produit en liquide d'ascite en vue des études de caractérisation. Bien qu'une réactivité croisée partielle ait été observée par les tests d'immunofluorescence indirecte et de neutralisation de l'infectivité envers la souche québécoise de référence (QC81), l'AcMo G9 a réagi spécifiquement avec la souche QC91 au test d'IHA. Aucune inhibition de l' activité hémagglutinante du virus QC81 n'a été démontrée. En outre un marquage spécifique à l'or colloïdal des projections de surface du virion (QC91) avec l'AcMo G9 a été observé en microscopie électronique. Les travaux préliminaires sur la mise au point d'une épreuve immunoenzymatique ont montré que les sérums polyclonaux de porcs infectés expérimentalement et de porcs ayant connu des épisodes de PPN entrent en compétition avec l'AcMo G9 spécifique à la souche QC91. L'analyse sérologique à l'aide de l' AcMe G9 de deux
autres isolats IAF-1747 et IAF-Klop (deux isolats associés à la PPN et provenant respectivement des mêmes fermes d'élevage et de fermes différentes du QC91) a démontré que ces derniers partageaient les mêmes déterminants antigéniques que le virus QC91. Cependant, la comparaison des séquences en acides aminés de la portion HAl du gène HA (excluant la séquence en acides aminés du peptide signal) de ces deux isolats avec celle déduite pour la souche QC91 a révélé 16 mutations en résidus d'acides aminés dans la séquence de 1' isolat IAF-Klop et 8 changements d'acides aminés dans celle de l'isolat IAF-1747. La réactivité de l'AcMe G9 envers le virus IAF-1192 (une
souche virale de l'influenza porcin A (H1N1) isolée des porcs en 1987 durant une épidémie de grippe porcine classique au Québec} a démontré que ces deux virus possédaient des déterminants antigéniques différents. Les études de séquençage ont montré qu'au ni veau de la portion HAl de la protéine HA, la souche IAF-1192 différait des souches QC91 et QC81 par au moins 19 et 12 acides aminés, respectivement.Ces travaux montrent que: 1. l' AcMe G9 de type IgGl est spécifique à la protéine HA du virus QC91, 2. les porcs produisent des anticorps contre l'épitope
différenciant la souche QC91 de la souche de référence
(QC81), 3. les différents isolats québécois associés à la PPN sont antigéniquement identiques à la souche QC91 en dépit de
leur diversité génétique considérable, 4. plusieurs souches distinctes (antigéniquement et
génétiquement) du virus de l'influenza porcin A(H1N1)
circulaient dans la population porcine au Québec de
1981 à 1990.


identifier: Beaud, Hermance  (2018). Effets des chimiothérapies pédiatriques sur l'intégrité de l'ADN des cellules germinales mâles  Thèse.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Doctorat en biologie, 229 p.

subject:
cancer pédiatrique
chimiothérapie
doxorubicine
fertilité masculine
spermatozoïdes
spermatogonie souche
réparation de l’ADN
Pediatric cancer
chemotherapy
doxorubicin
male fertility
spermatozoa
spermatogonia stem cell
DNA repair

abstract:
Les hommes survivants de cancers pédiatriques sont plus susceptibles que leurs frères sans historique de cancer d’être infertiles. Avant la puberté, les cellules germinales sont principalement des spermatogonies, dont des spermatogonies souches (SSC). Le potentiel génotoxique des agents de chimiothérapie sur les SSC reste incertain, et les mécanismes de réparation de l’ADN dans les SSC sont peu décrits. De plus, il n'est toujours pas clair si les spermatozoïdes produits plusieurs années après la rémission d’un cancer pédiatrique sont endommagés. Notre étude transversale chez des hommes survivants de leucémie ou lymphome pédiatriques suggère qu‘indépendamment de l'âge au diagnostic les survivants de cancers pédiatriques présentent un risque plus élevé d'infertilité en raison d’un compte spermatique faible ou nul, mais que lorsque des spermatozoïdes sont produits les risques d’anomalies de l'ADN et de la chromatine apparaissent similaires à ceux observés dans la population générale. Toutefois, l'exposition à la doxorubicine pourrait avoir des conséquences à long terme sur l'intégrité de l’ADN des spermatozoïdes de survivants de cancers pédiatriques. Sur une lignée de spermatogonies de rat aux propriétés de SSC (GC-6spg), nous avons démontré la cytotoxicité dose-dépendante de la doxorubicine via l’induction de cassures de l’ADN. De plus, nous avons mesuré l’expression constitutive de 75 gènes impliqués dans la réparation de l’ADN, dont l’expression de 16 gènes est affectée par la doxorubicine (>1.5 d’amplification ; P <0.05). Après arrêt du traitement, les cassures de l’ADN induites dans les GC-6spg retrouvent des niveaux similaires aux témoins. Ces résultats supportent l’idée que les spermatogonies indifférenciées peuvent répondre aux dommages à l’ADN induits par des composés de chimiothérapies et peuvent échapper à l’accumulation de cassure de l’ADN. Pour déterminer si un mécanisme similaire de défense est activé in vivo dans le testicule prépubère, nous avons développé un modèle d’exposition des SSC à la doxorubicine chez des rats transgéniques exprimant spécifiquement la GFP dans les cellules germinales. Après 24h de traitement, l’expression de gènes de réparation de l’ADN ne varie pas dans les cellules germinales isolées par cytométrie en flux, en comparaison des cellules germinales témoins, suggérant qu’une défaillance des mécanismes de réparation de l’ADN pourrait être la cause de la toxicité de la doxorubicine. Ensemble, les travaux de cette thèse soulignent l’importance de mieux comprendre les effets des agents de chimiothérapies sur les SSC pour mieux informer les patients et ouvrir de nouvelles pistes de recherche dans la prévention de ces effets secondaires.

Men survivors of pediatric cancers are more likely than their brothers without cancer history to be infertile. Before puberty, germ cells are mainly spermatogonia, including spermatogonia stem cells (SSC). The genotoxic potential of chemotherapy agents on SSC remains uncertain, and the mechanisms of DNA repair in SSC are poorly described. In addition, it is still unclear whether spermatozoa produced several years after the remission of pediatric cancer are damaged. Our cross-sectional study in men survivors of pediatric leukemia or lymphoma suggests that, regardless of the age of diagnosis, pediatric cancer survivors have a higher risk of infertility due to low or no sperm count, but when spermatozoa are produced, the risks of DNA and chromatin abnormalities appear similar to those observed in the general population. However, exposure to doxorubicin may have long-term consequences on the DNA integrity of spermatozoa from pediatric cancer survivors. In a rat spermatogonia cell line with SSC (GC-6spg), we demonstrated the dose-dependent cytotoxicity of doxorubicin by the induction of DNA breaks. In addition, we measured the constitutive expression of 75 genes involved in DNA repair, whose expression of 16 genes is affected by doxorubicin (> 1.5 amplification, P <0.05). After treatment arrest, DNA breaks induced in GC-6spg returned to levels similar to controls. These results support the idea that undifferentiated spermatogonia can respond to DNA damage induced by chemotherapy compounds, and can escape from DNA breaks accumulation. To determine if a similar defence mechanism is activated in vivo in the prepubertal testis, we have developed a model of exposure of SSC to doxorubicin in transgenic rats specifically expressing GFP in germ cells. After 24 hours of treatment, the expression of DNA repair genes in germ cells isolated by flow cytometry was not different to control germ cells, suggesting that a failure of DNA repair mechanisms could induce the toxicity of the doxorubicin. Together, the work of this thesis highlight the importance to better understand the effects of chemotherapeutic agents on SSC, to better inform patients and open up new research avenues in the prevention of these side effects.


identifier: Chartrand, Karine  (2018). L'utilisation de la nanoparticule du virus de la mosaïque de la papaye dans le traitement de l'infection virale chronique: effet de l'interférence des anticorps et de la régulation de la voie de signalisation du TLR7  Mémoire.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en virologie et immunologie, 176 p.

subject:
Vaccination thérapeutique
nanoparticules virales
virus de la mosaïque de la
papaye
interféron alpha
cellules dendritiques plasmacytoïdes
virus de la chorioméningite
lymphocytaire
anticorps
Therapeutic vaccination
viral nanoparticles
papaya mosaic virus
interferon alpha
plasmacytoid dendritic cells
lymphocytic choriomeningitis virus
antibodies

abstract:
Bien que la vaccination prophylactique soit un des meilleurs moyens de prévenir les infections, la
vaccination thérapeutique reste encore en développement. L’utilisation de virus atténués ou inactivés comme plateforme vaccinale n’est pas toujours possible dû à des problèmes de sécurité. Une des alternatives sécuritaires à la vaccination classique repose sur l’utilisation de
nanoparticules virales, qui permettent d’imiter l’agent pathogène sans risques d’infections pour l’hôte. Nous avons auparavant démontré que l’utilisation prophylactique de nanoparticules du virus de la mosaïque de la papaye (PapMV) permet de protéger la souris d’infections virales et
bactériennes grâce à l’activation de la réponse immunitaire humorale et cellulaire. Nous avons aussi démontré le potentiel du PapMV en tant qu’immunothérapie dépendante de l’interféron de type I (IFN-I) dans le traitement d’un modèle de cancer localisé. Nous nous sommes donc intéressés au fort potentiel de production de l’IFN-a du PapMV dans le traitement d’une infection virale chronique tel que celle provoquée par la souche Cl13 du virus de la chorioméningite
lymphocytaire (LCMV). Le traitement de souris infectées au LCMV Cl13 par deux immunisations systémiques de PapMV n’induit aucun changement dans les titres viraux de LCMV Cl13 ou dans la réponse immunitaire montée contre ce virus. De plus, la production d’IFN-a suite à une immunisation au PapMV est complètement abolie chez les souris infectées. Afin de mieux isoler les mécanismes responsables de cette tolérance au PapMV, nous avons déterminé l’influence d’un prétraitement au PapMV sur des immunisations subséquentes de PapMV. Une immunisation au PapMV précédée d’un prétraitement au PapMV est incapable d’induire la production d’IFN-α pendant au moins 50 jours suivant la deuxième immunisation et la réponse immunitaire est grandement affectée suite a ce régime d’immunisation. Nous avons démontré que deux mécanismes distincts seraient responsables de cet effet de tolérance. La tolérance à court terme résulterait partiellement de la dégradation d’IRAK1, une composante essentielle de la cascade de signalisation du TLR7, alors que l’inhibition à long terme semble être principalement due à l’interférence des anticorps spécifiques au PapMV. Nous avons donc identifié certains défis importants dans l’utilisation de nanoparticules virales dans le traitement systémique d’infections virales chroniques et nous discutons d’alternatives à ces défis.

lthough vaccination has been an effective way of preventing infections ever since the 18th century, the generation of therapeutic vaccines and immunotherapies is still in development. Several challenges impede the development of these therapeutic approaches such as safety issues. One safe alternative to classical vaccination methods gaining recognition is the use of nanoparticles, whether synthetic or naturally derived. We have recently demonstrated that the papaya mosaic virus-like (PapMV) nanoparticle can be used as a prophylactic vaccine against various viral and bacterial infections through the induction of protective humoral and cellular immune responses. Moreover, PapMV is also very efficient when used as an immune adjuvant in an immunotherapeutic setting at slowing down the growth of aggressive mouse melanoma tumors in a type I interferon (IFN-I)-dependent manner. In the present study we were interested in exploiting the capacity of PapMV to induce robust IFN-I production as treatment for the chronic viral infection model lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) Clone 13 (Cl13). Treatment of LCMV Cl13-infected mice with two systemic administrations of PapMV was ineffective, as shown by the lack of changes in viral titers and immune response to LCMV following treatment. Moreover, IFN-α production following PapMV administration was almost completely abolished in LCMV infected mice. To better isolate the mechanisms at play, we determined the influence of a pre-treatment with PapMV on secondary PapMV administration. Pre-treatment with PapMV led to the same outcome as an LCMV infection in that IFN-α production following secondary PapMV immunization was abrogated for up to 50 days while immune activation was also dramatically impaired. We showed that two distinct and overlapping mechanisms were responsible for this outcome. While short-term inhibition was partially the result of IRAK1 degradation, a crucial component of the TLR7 signaling pathway, long-term inhibition was mainly due to interference by PapMV-specific antibodies. Thus, we identified a possible pitfall in the use of virus-like particles for the systemic treatment of chronic viral infections and discuss mitigating alternatives to circumvent these potential problems.


identifier: Clabault, Hélène  (2018). Effets de inhibiteurs sélectifs de la recapture de la sérotonine sur le développement du trophoblaste villeux et extravilleux placentaire humain  Thèse.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Doctorat en biologie, 251 p.

subject:
antidépresseur
grossesse
placenta
fusion
différenciation
invasion
migration
prolifération
métalloprotéase matricielle
antidepressant
pregnancy
placenta
fusion
differentiation
invasion
migration
proliferation
matrix metalloproteinase

abstract:
Une femme sur cinq sera atteinte de dépression durant la grossesse, et 8-13 % d’entre elles seront traitées avec des inhibiteurs sélectifs de la recapture de la sérotonine (ISRS), la classe d’antidépresseurs la plus prescrite chez les femmes enceintes. Le bon déroulement d’une grossesse et du développement foetal est tributaire de bons développement et fonctionnement placentaires. Les cellules trophoblastiques, cellules-clefs du placenta, se différencient selon deux phénotypes : le cytotrophoblaste villeux (CTBv) et le cytotrophoblaste extravilleux (CTBev). Les CTBv (mononucléées) fusionnent et se différencient pour former le syncytiotrophoblaste (STB; plurinucléé) ; c’est la syncytialisation. Les CTBev migrent et envahissent la muqueuse utérine, et sont indispensables à l’implantation et au remodelage des artères spiralées utérines maternelles. Un défaut d’invasion/migration ou de syncytialisation peut causer des complications importantes de grossesse, voire même une mortalité maternelle ou foetale. Pourtant, l’effet des ISRS sur le développement du trophoblaste humain n’a jamais été étudié.  Basé sur la littérature scientifique, les hypothèses de recherche sont que les ISRS à des concentrations thérapeutiques (0.03 à 10 μM) : (1) n’ont pas d’effet sur la syncytialisation du CTBv, et (2) altèrent le processus d’implantation via l’inhibition de l’invasion, de la migration et de la prolifération des CTBev. Les objectifs spécifiques sont de déterminer l’effet des ISRS (fluoxétine, norfluoxétine, sertraline, venlafaxine, citalopram et paroxétine) sur : (1) la différenciation fonctionnelle (sécrétion de l’hormone gonadotrophine chorionique humaine (hCG)) et morphologique (fusion), et l’apoptose du trophoblaste villeux, dans les cellules de choriocarcinome BeWo et les primocultures de CTBv de placentas de grossesse normale à terme ; et (2) l’invasion, la migration et la prolifération des CTBev, dans les lignées JEG-3 (choriocarcinome) et HIPEC (dérivée de primocultures humaines de trophoblastes extravilleux). Les résultats démontrent qu’aucun de ces ISRS, aux concentrations retrouvées dans le sang maternel et dans le sang de cordon, n’a d’effets cytotoxiques, mais qu’ils ont des effets concentration- et structure-dépendants sur l’une ou l’autre des caractéristiques étudiées (fusion, différenciation biochimique, invasion, migration). Les résultats montrent également une différence de sensibilité aux ISRS entre les CTBv et les CTBev (prolifération, cycle cellulaire), ainsi qu’entre les lignées et les primocultures. Cette étude permet de mieux comprendre les effets des antidépresseurs de type ISRS sur le développement placentaire. Elle permet d’avoir une meilleure idée de quel ISRS a le plus d’impact sur les trophoblastes villeux et extravilleux (e.g. sertraline) et fournit de nouvelles connaissances pour éclairer la communauté scientifique et les praticiens sur le bien-fondé de l’utilisation de ISRS pour le traitement des femmes enceintes dépressives.

 One in five women will develop depression during pregnancy, and 8-13% of them will be treated with selective serotonin reuptake inhibitors (SSRIs), which is the most commonly prescribed antidepressant class during pregnancy. Sucessful pregnancy and healthy fetal development depends on the quality of placental development and function. Trophoblasts, key placental cells, differentiate into two phenotypes: villous cytotrophoblasts (vCTB) and extravillous cytotrophoblasts (evCTB). vCTBs (mononucleated) fuse and differentiate to form the syncytiotrophoblast (STB, plurinucleated); a process called syncytialization. evCTBs migrate and invade the maternal uterus, and are crucial for embryo implantation and for the adaptation of maternal spiral arteries. A defect of invasion / migration or syncytialization can cause significant pregnancy complications, and even maternal or fetal mortality. However, the effect of SSRIs on the human trophoblast development has never been studied.  Based on the scientific literature, the research hypotheses are that the SSRIs at therapeutic concentrations (0.03 to 10 μM): (1) have no effect on the syncytialization of vCTBs, and (2) alter the implantation process via inhibition of invasion, migration and proliferation of evCTBs. The specific objectives are to determine the effects of SSRIs (fluoxetine, norfluoxetine, sertraline, venlafaxine, citalopram and paroxetine) on: (1) functional differentiation (human chorionic gonadotropin (hCG) secretion), morphological differentiation (fusion) and villous trophoblast apoptosis, in BeWo choriocarcinoma cells and human placental trophoblast cells from normal term pregnancy placentas; and (2) invasion, migration and proliferation of CTBev, in JEG-3 (choriocarcinoma) and HIPEC (derived from human primary extravillous trophoblast cells) lines. The results demonstrate that none of these SSRIs, at concentrations found in maternal blood and cord blood, have cytotoxic effects, but that they have concentration- and structure-dependent effects on one or the other studied characteristics (fusion, biochemical differentiation, invasion, migration). The results also show a sensitivity difference to SSRIs between CTBv and CTBev (proliferation, cell cycle), as well as between cell lines and primary cells. This study provides insights into the effects of SSRIs on placental development. It provides a better idea of which SSRIs have the greatest impact on villous and extravillous trophoblasts (e.g. sertraline) and provides new insights to inform the scientific community and practitioners about the appropriateness of using SSRIs for the treatment of depressed pregnant women.


identifier: Garcia Caballinas, Daniel  (2018). Identification de facteurs de l’hôte dans l’épreuve de force moléculaire pour la formation et transport des usines de réplication du virus de la mosaïque du navet  Thèse.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Doctorat en virologie et immunologie, 331 p.

abstract:
Les virus à ARN positif (ARN+) induisent une réorganisation des membranes de certains organites de la cellule hôte pour former des compartiments de réplication virale. Ces compartiments sont formés dès les premières étapes de l’infection et prennent le nom d’usines de réplication virale. Les usines abritent tous les éléments nécessaires à la réplication virale. Le travail effectué au cours de ma thèse s’est concentré sur la compréhension des
voies de transport empruntées par ces usines. Le modèle d’étude utilisé dans les travaux menés au cours de ma thèse a été le virus de la mosaïque du navet (Turnip mosaic virus(TuMV)) qui est un virus non enveloppé à ARN+ simple brin de plante (genre Potyvirus). Pour ce virus, le remodelage du réticulum endoplasmique (RE) par la protéine virale 6K2 donne naissance à des usines virales très mobiles. Pour répondre à cet objectif global, j’ai travaillé sur trois études de recherche scientifique au cours de ma thèse.La première partie de l’étude a eu pour but de déterminer d’une part si les usines de réplication virale du TuMV entraient dans la voie de sécrétion conventionnelle des protéines et d’autres par de connaître les trajectoires intracellulaires empruntées. L’étude de plusieurs mutants de la protéine 6K2 qui ont été faits par mutagenèse dirigée et l’emploi de divers moyens de blocage du transport des protéines entre le RE et l’appareil de Golgi, ont permis de répondre à une première partie de l’objectif, en dévoilant l’existence de voies alternatives. La deuxième partie de l’objectif a eu pour but de déterminer les potentielles destinations cellulaires des usines virales, pour ce faire, des protéines SNARE (Soluble N-éthylmaleimide-sensitive-factor Attachment protein REceptor ) situées dans divers compartiments ont été utilisées. Pour répondre à la deuxième partie de l’objectif des analyses complémentaires ont été menées par microscopie confocale, par des techniques de biochimie, de biologie moléculaire et de génétique. Les approches suivies ont permis non seulement de caractériser le chemin intracellulaire emprunté par les usines de réplication virale, mais aussi d’identifier des protéines de l’hôte essentielles à l’infection virale. Cette partie sera développée dans le chapitre 3. La deuxième partie de l’étude a eu pour objectif de dévoiler les différents types cellulaires colonisés par les usines de réplication du TuMV, avec une particulière attention sur les vaisseaux vasculaires de la plante. Pour ce faire, des observations de coupes histologiques ont été effectuées d’une part par microscopie électronique à transmission et d’autres part par microscopie confocale suite à un marquage par immunofluorescence. Les analyses de microscopie ont été combinées à des caractérisations biochimiques de sève. Cette partie sera exposée en détail dans l’Annexe A. Enfin, une troisième partie de l’étude a voulu exploiter les informations découvertes dans les deux premières parties pour mieux comprendre l’origine des usines de réplication virale présentes dans les vaisseaux vasculaires en continuité avec le milieu extracellulaire. La stratégie menée a eu pour but de caractériser les vésicules extracellulaires par microscopie électronique à transmission, par microscopie confocale et par des analyses protéomiques. Cette partie sera plus amplement présentée dans le chapitre 4. Ainsi, les résultats qui sont présentés tout au long de ma thèse, ont permis d’avoir une meilleure compréhension sur les routes cellulaires, vasculaires et extracellulaires empruntées par les usines virales du TuMV. De plus, les usines de réplication virale du TuMV interviennent dans quasiment toutes les étapes du cycle viral du TuMV. Dans ce contexte, les résultats obtenus durant ma thèse soulignent l’importance de l’attention qui devrait être portée à l’étude des usines de réplication virale du TuMV et par extension à celles d’autres virus à ARN+, afin d’identifier de nouvelles cibles de résistance ou de traitement.


identifier: Lamine-Ajili, Asma  (2018). Les propriétés antiapoptotiques et antiautophagiques du Pituitary Adenylate Cyclase-Activating Polypeptide assurent une protection neuronale dans des modèles in vitro et in vivo de la maladie de Parkinson  Thèse.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Doctorat en biologie, 194 p.

subject: maladies neurodégénératives

subject: neurodégénérescence

subject: maladie de

subject: Parkinson

subject: modèles parkinsoniens in vitro et in vivo

subject: PACAP

subject: apoptose

subject: antiapoptotique

subject: autophagie

subject: antiautophagique

subject: neurodegenerative diseases

subject: neurodegeneration

subject: Parkinson's disease

subject: in vitro and in vivo parkinsonian models

subject: PACAP

subject: apoptosis

subject: antiapoptotic

subject: autophagy

subject: antiautophagic

abstract:
La maladie de Parkinson (MP) est caractérisée par la dégénérescence des neurones dopaminergiques du mésencéphale. Elle est notamment causée par des évènements délétères tels le stress oxydatif et la neuro-inflammation, et ceux-ci mènent à la destruction des neurones par divers types de mort cellulaire. Dans ce contexte, le Pituitary Adenylate Cyclase-activating Polypeptide (PACAP), avec ses propriétés
antiapoptotiques, anti-inflammatoires et antioxydantes et son aptitude à traverser la barrière hémoencéphalique (BHE), est capable d’exercer une puissante activité neuroprotectrice dans divers modèles de la MP. Par conséquent, cette molécule est prometteuse pour le développement d’une thérapie médicamenteuse. Toutefois, ses
profils pharmacologiques (actions non sélectives) et pharmacocinétiques (faible stabilité métabolique) limitent son utilisation clinique. Ainsi, dans une perspective de mise au point d’une approche thérapeutique, nous avons conçu l’Ac-[Phe(pI)6, Nle17]PACAP(1-27), un analogue du PACAP possédant des profils pharmacologiques et métaboliques améliorés, et avons testé son effet sur des modèles in vitro et in vivo de la MP. In vitro (neuroblastomes humains SH-SY5Y), l’analogue stimule efficacement la production d'AMPc et réduit l’altération de l’activité mitochondriale provoquée par un agent neurotoxique (MPP+; 1-méthyl-4-phénylpyridinium). In vivo (souris traitées avec le 1-méthyl-4-phényl-1,2,3,6-tétrahydropyridine, un précurseur métabolique du MPP+), le PACAP et son dérivé synthétique restaurent l’expression de la tyrosine hydoxylase dans la substance noire et modulent la réponse inflammatoire. Bien que des baisses de la pression artérielle soient observées avec les deux peptides, l'intensité de la chute ainsi que sa durée sont significativement moins élevées avec l'analogue. Nos caractérisations biologiques ont donc montré que la mort neuronale causée par l’agent neurotoxique est considérablement atténuée par l’analogue peptidique. Elles ont également établi que cet effet est peut-être lié à une activité antiapoptotique soutenue. Dans un deuxième temps, nous avons exploré l’effet du PACAP sur le processus autophagique observé dans ces mêmes modèles de la MP. Nous avons ainsi démontré que le PACAP réduit significativement l’activité autophagique, comme évaluée par la production du complexe LC3-II, le rétablissement des niveaux protéiques de la p62, et la diminution de la formation des vacuoles autophagiques. La capacité du PACAP à inhiber l'autophagie a également été observée in vitro, et ce, en inhibant l'activité de p62 induite par la rapamycine, un inducteur de l'autophagie. Ainsi, nos travaux ont conduit à la description d’une molécule dérivée du PACAP, métaboliquement stable, qui s’avère aussi puissante que le peptide natif au niveau de la neuroprotection. Ils ont aussi révélé que le PACAP possède des propriétés antiautophagiques dans des modèles de la MP.

Parkinson's disease (PD) is characterized by the degeneration of mesencephalic dopaminergic neurons. In particular, it is caused by deleterious events such as oxidative stress and neuro-inflammation, which lead to the destruction of neurons by several types of cell death. In this context, the Pituitary Adenylate Cyclase-Activating Polypeptide(PACAP), with its antiapoptotic, anti-inflammatory and antioxidant properties, as well as
its ability to cross the blood-brain barrier (BBB), is able to exert a potent neuroprotective activity in various PD models. Therefore, this molecule is promising for the development of a PACAP-based drug therapy. However, its pharmacological (non-selective) and pharmacokinetic (low metabolic stability) profiles limit its clinical use. Thus, from the perspective of developing a therapeutic approach, we designed the analog Ac-[Phe(pI)6, Nle17]PACAP(1-27), a PACAP derivative with improved pharmacological and metabolic profiles, and tested its effects in in vitro and in vivo PD models. In vitro (SH-SY5Y human neuroblastoma cells), the analog effectively stimulates the production of cAMP and reduces the alteration of mitochondrial activity caused by a neurotoxic agent (MPP+; 1-methyl-4-phenylpyridinium). In vivo (mice treated with 1-methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine, a metabolic precursor of MPP+), PACAP and its synthetic derivative restore tyrosine hydroxylase expression in the substantia nigra and modulate the inflammatory response. Although decreases in blood pressure were observed with both peptides, the intensity of the fall and its duration were significantly lower with the analog. Our biological characterizations have thus shown that the neuronal death caused by the neurotoxic agent is considerably attenuated by the peptide analog. They also established that this effect may be related to sustained antiapoptotic activity. In a second step, we explored the effect of PACAP on the autophagic process observed in these same PD models. Thus, we have demonstrated that PACAP significantly reduces autophagic activity, as assessed by the production of the LC3-II complex, the restoration of the p62 protein levels, and the decreased formation of autophagic vacuoles. The ability of PACAP to impede autophagy was also observed in vitro, by the inhibition of the p62 activity produced by rapamycin, an inducer of autophagy. In summary, our work led to the description of a PACAP-derived molecule, metabolically stable, that proved to be in neuroprotection as potent as the native peptide. Our studies also revealed that PACAP possesses antiautophagic properties in PD models.


identifier: Le Coupanec, Alain  (2018). Conséquences neurologiques des clivages de la glycoprotéine S du coronavirus neuroinvasif humain OC43  Thèse.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Doctorat en virologie et immunologie, 360 p.

subject:
HCoV-OC43
Coronavirus
Glycoprotéine de surface
Clivage protéolytique
Protéases
Neuroinvasion
Neuropropagation
Neurotropisme
Production virale
Pathogénèse

abstract: Les coronavirus humains (HCoV) sont des virus respiratoires opportunistes infectant les voies respiratoires supérieures pour y provoquer le rhume. Ces virus peuvent également envahir le système nerveux central (SNC) et y infecter les cellules résidentes, étant ainsi potentiellement associés au développement de maladies neurologiques. Les travaux de recherche du laboratoire ont montré que la souche HCoV-OC43 est neuroinvasive et neurotrope chez l'humain et chez la souris. La glycoprotéine virale S est un des facteurs de virulence majeurs pour plusieurs coronavirus, incluant le HCoV-OC43. Afin d’étudier le rôle de cette protéine dans la neuroinvasion et dans la propagation virale au SNC et d’identifier les acides aminés associés à cette fonction, nous avons comparé la séquence du gène S de la souche de référence du laboratoire à celles de virus détectés à partir d’isolats cliniques des voies respiratoires humaines. Bien que la séquence du site de clivage potentiel S2' situé en amont du peptide de fusion reste inchangée, nous avons pu mettre en évidence que l’ensemble des virus provenant des isolats cliniques possédait (parmi 7 mutations prépondérantes), une mutation dans le gène S favorisant la création d’un site de clivage pour la furine nommée S1/S2. Ainsi, nous avons, à l'aide de clones infectieux, obtenus des virus mutants au niveau des sites S1/S2 (G758R) et à S2' (R903A). Nous avons pu mettre en évidence que les propriétés neuroinvasives de ces variants sont altérées. De plus, nous avons observé une diminution de la propagation des variants G758R et R903A dans des lignées de cellules neurales, ainsi qu'à l’intérieur du SNC associée à une neurovirulence atténuée, voire inexistante chez la souris. Nous avons pu démontrer que le HCoV-OC43 envahit le SNC principalement par le nerf olfactif et l’ensemble de nos résultats suggère un rôle important des différents clivages (S1/S2 et S2') de la glycoprotéine S dans une interaction hôte-pathogène.  Cette étude nous a permis de mieux caractériser le rôle des clivages de la glycoprotéine S dans la neuroinvasion, le neurotropisme et la neurovirulence. Nous pouvons maintenant spéculer quant à de possibles cibles thérapeutiques. En permettant un clivage au niveau de S1/S2 par des protéases de l'hôte, et en inactivant celui à S2', nous pourrions affecter la neuroinvasion et la neuropropagation, ainsi que la neurovirulence potentielle associée à une infection par le HCoV-OC43 chez l'humain.


identifier: Tremblay, Amélie  (2018). Étude in vitro de l'induction de stress oxydatif par la doxorubicine dans les cellules de sertoli immature et les spermatogonies  Mémoire.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en science expérimentale de la santé, 151 p.

subject:
antioxydants
doxorubicine
stress oxydatif
spermatogonie
cellule de Sertoli
testicule

abstract: Les traitements de chimiothérapie peuvent affecter la fertilité masculine à long terme, même lorsqu’administrés avant la puberté. En effet, le testicule pré-pubère contient des spermatogonies et des cellules de Sertoli immatures, qui sont des cibles connues des chimiothérapies. Malheureusement, aucune solution de préservation de la fertilité n'est disponible pour les garçons pré-pubères. Des études suggèrent que la doxorubicine, un agent de chimiothérapie utilisé à large échelle en oncologie pédiatrique, induit un stress oxydatif dans le testicule. Cependant, les types cellulaires ciblés par ce stress restent inconnus. Le but de cette étude était de déterminer si la doxorubicine induit un stress oxydatif dans les spermatogonies et les cellules de Sertoli du testicule immature, puis d'évaluer leur protection par des antioxydants. Pour ce faire, nous avons utilisé un modèle in vitro de lignées de spermatogonies (GC-6Spg) et de cellules de Sertoli immatures (Ser-W3) de rat. D’abord, nous avons montré que la doxorubicine induit une cytotoxicité temps- et dose-dépendante dans les deux lignées cellulaires. Cependant, lors de l’évaluation du stress oxydatif, les espèces réactives de l'oxygène et le 8-oxo-désoxyguanosine nucléaire ont augmenté seulement dans les Ser-W3. De plus, les niveaux de glutathion réduit intracellulaire ont diminué dans les Ser-W3. Ces résultats montrent que la doxorubicine induit un stress oxydatif dans la lignée cellulaire Ser-W3. Par contre, bien qu’une supplémentation du glutathion intracellulaire offre une diminution faible mais significative de la cytotoxicité de la doxorubicine sur les Ser-W3, une déplétion du glutathion n'affecte pas leur survie. Ceci laisse supposer que le système d’antioxydant du glutathion n'est pas essentiel pour la défense des Ser-W3 contre la doxorubicine. De plus, parmi quatre antioxydants sélectionnés dans la littérature, aucun n’a été en mesure de réduire la cytotoxicité de la doxorubicine dans les GC-6Spg et les Ser-W3. Dans l’ensemble, nos données suggèrent que le stress oxydatif n’est probablement pas une voie majeure de toxicité de la doxorubicine dans les GC-6Spg et les Ser-W3. Ainsi, ce projet de recherche aide à mettre en évidence les mécanismes de toxicité des chimiothérapies sur le testicule pré-pubère, avec pour but à long terme d’améliorer la qualité de vie des survivants de cancers pédiatriques.


identifier: Vallières, Francis  (2017). Caractérisation du rôle de l'IL-21 dans la biologie des monocytes et des macrophages humains  Thèse.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Doctorat en biologie, 199 p.

abstract: L’interleukine (IL)-21 est membre de la famille des cytokines utilisant la chaine commune γ de récepteur (R) ou le CD132. Cette famille de cytokines est connue pour être parmi les plus étudiées en immunologie. L’IL-21 est principalement sécrétée par les lymphocytes T CD4+ activés, notamment les lymphocytes TFH et TH17, mais également par les cellules NKT. Elle est associée à différentes pathologies inflammatoires et auto-immunes telles que l’arthrite rhumatoïde, les maladies inflammatoires de l’intestin et le lupus érythémateux systémique. Bien que l’effet de l’IL-21 soit bien caractérisé dans les cellules d’origine lymphoïdes, le rôle biologique du système IL-21/IL-21R dans les monocytes et les macrophages humains demeure peu documenté. Dans cette étude, nous avons approfondi les connaissances sur l’effet de l’IL-21 dans la biologie des monocytes et des macrophages humains en évaluant sa capacité à moduler certaines de leurs fonctions. D’abord, nous avons confirmé l’expression de l’IL-21R à la surface de la lignée cellulaire THP-1, des monocytes humains et des macrophages différenciés à partir de monocytes humains en présence de GM-CSF (MDMH). Puis, nos résultats montrent que l’IL-21 augmente la capacité de ces cellules à exercer la phagocytose effectuée par l’entremise des récepteurs Fc. L’augmentation de la phagocytose n’était pas associée à un accroissement de l’expression du CD16, du CD32, du CD64, ni de celle de l’IL-21R par l’IL-21. L’IL-21 active la voie Jak/STAT, celle des MAPK (ERK et p38), celle de la PI3K/Akt et Syk tel que montré par l’augmentation de leur niveau de phosphorylation. Également, une association constitutive entre l’IL-21Rα et Syk a été observée. Conséquemment, le rôle de l’activation de Syk, de ERK 1/2 de la voie Jak/STAT et de la PI3K/Akt dans l’augmentation des capacités phagocytaire en réponse à l’IL-21 dans ces cellules a été validé par l’utilisation d’inhibiteurs pharmacologiques. De surcroît, l’IL-21 accroît la phagocytose de particule de zymosan par les MDMH. Cette dernière dépend également de l’activation des mêmes voies de signalisation. L’IL-21 ne module toutefois pas l’endocytose, la phagocytose de bactéries et ni celle de particules de zymosan par les monocytes humains. Nos résultats montrent aussi que l’IL-21 n’est pas un agent chimioattractant pour les monocytes humains. Elle accroît cependant l’adhésion des monocytes aux cellules endothéliales, et ce de manières dépendantes de l’activation de Syk. Finalement l’IL-21 stimule la sécrétion de MMP-9 par les MDMH. L’IL-21 possède donc des effets biologiques significatifs dans les monocytes et les macrophages humains. Par conséquent, le développement de stratégies thérapeutiques ciblant le système IL-21/IL-21R devra considérer que la physiologie des monocytes et des macrophages peut en être affectée.


identifier: Weber-Ouellette, Anne  (2018). Conception d'un modèle de co-culture de cellules luminales épithéliales MCF-12A et de cellules myoépithéliales HS 578BST représentatif d'un acinus de la glande mammaire in vitro  Mémoire.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en science, 110 p.

subject:
glande mammaire
co-culture
Matrigel
MCF-12A
Hs 578Bst
acinus bicouche
jonctions

abstract:
 La glande mammaire est composée d’un épithélium bicouche ramifié qui consiste en une couche interne de cellules luminales polarisées, bordées par une couche externe de cellules basales, principalement des cellules myoépithéliales. L’épithélium est séparé du stroma de la glande mammaire par une membrane basale. Tout au long du développement de l’épithélium, la prolifération et la différenciation requièrent une étroite régulation entre ces deux couches par l’intermédiaire des jonction intercellulaires. L’étude de ces interactions in vitro nécessite la conception d’un modèle tridimensionnel (3D) hétérotypique de la glande mammaire. L’objectif de
cette étude était de concevoir un modèle reproductible et physiologiquement pertinent de l’unité fonctionnel, l’acinus bicouche, de glande mammaire in vitro 3D. Nos résultats proviennent de la co-culture, pendant quatorze jours, des lignées cellulaires luminales MCF-12A et myoépithéliales
Hs 578Bst non-tumorigéniques dans le Matrigel® – un extrait de membrane basale riche en laminine. Différentes conditions de culture ont été essayées, dont le ratio cellulaire, la
concentration du Matrigel® et le milieu de culture. Ces acini bicouches ont été caractérisés par microscopie confocale à l’aide de marqueurs épithéliaux et myoépithéliaux et par cryosection. Nos résultats démontrent qu’il est possible de reproduire des acini bicouches in vitro. Ces acini in vitro permettront de comprendre le rôle des interactions intercellulaires dans le développement normal de la glande mammaire. De plus, ils révéleront comment leur perturbation peut induire un phénotype cancéreux.


identifier: Bélair, Sophie  (1995). Isolement de nouveaux taxanes et biosynthèse du taxol  Mémoire.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en microbiologie appliquée, 155 p.

abstract:
Le taxol, produit naturel extrait de l'écorce de l'if du Pacifique (Taxus brevifolia), possède des propriétés anticancéreuses. Depuis 1993, il est autorisé pour le traitement du cancer ovarien. Le taxol est administré aux patientes dont le cancer résiste aux traitements standards. Les résultats cliniques démontrent que ce médicament est fort prometteur d'autant plus qu'il semble également actif contre le cancer du sein et du poumon. Le taxol est retrouvé chez plusieurs espèces d'ifs. L'if sur lequel nous travaillons est l'if du Canada ou Taxus canadensis. Ce conifère est un petit arbuste où les taxanes sont extraits à partir des aiguilles. Taxus canadensis a été étudié pour la première fois en 1990 par l'Institut Nationnal de Cancer des EtatsUnis(NCI). Lors de ces premiers travaux, le taxol ainsi que deux autres taxanes; cephalomannine et 10-deacetylbaccatin Ill, ont été isolés. La découverte de nouveaux taxanes présente un intérêt pour les divers aspects de l'étude du taxol. En effet, la découverte de nouvelles structures a, entre autres, permis l'avancement dans les études de synthèse organique ainsi que dans les études sur l'activité biologique du taxol. l'aspect à lequel nous nous intéressons est la biosynthèse. Nous aimerions connaître les voies biosynthétiques menant à la formation du taxol. La découverte de nouveaux taxanes peut nous aider à construire un schéma de biogénèse du taxol. la première partie de nos travaux de recherche consistait à trouver quels
autres taxanes sont produits par Taxus canadensis. Plusieurs nouveaux taxanes ont été découverts. J'ai participé à l'isolement et à la purification de trois de ces composés. les composés 7,9-deacetylbaccatin VI et ·1 13-hydroxy-7,9-deacetylbaccatin 1 étaient de nouvelles structures tandis que le composé epi-taxai était isolé pour la première fois dans Taxus canadensis. Parallèlement à ces travaux, nous avons développé une méthode pour étudier la biosynthèse du taxai à l'aide de la technique de "kinetic pulse labelling". Cette méthode consiste à ajouter un précurseur radioactif dans un homogénat d'aiguilles de Taxus .canadensis et de suivre dans le temps l'incorporation du précurseur dans le taxai ainsi que dans les autres taxanes. Nos travaux, quoique préliminaires, semble démontrer que le taxai se forme au cours des premières heures d'incubation. Nous avons obtenu une augmentation de l'incorporation du précurseur radioactif dans le pic au temps de rétention du taxai après cinq heures d'incubation. D'après nos travaux de biosynthèse, le nouveau composé 7,9-deacetylbaccatin VI ne semble pas être un intermédiaire à la formation du taxai. D'après sa structure chimique très similaire au taxai, ce composé aurait pu être plausiblement un intermédiaire à la biosynthèse du taxai. La radioactivité des composés 1 P-hydroxy-7,9-deacetylbaccatin 1 et epi-taxai n'a pu être suivie étant donné que ces composés sont retrouvés en trop faible concentration et que sur le chromatogramme de J'extrait initial, leurs pics ne se différencient pas des autres pics.


identifier: Lippé-Maheu, Charlotte  (2018). Mixité sociale et cohabitation interethnique : le cas de la Cité de l'Acadie  Mémoire.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en études urbaines, 125 p.

subject:
mixité sociale
cohabitation interethnique
immigration
ethnicité
groupes ethniques
groupes socioéconomiques
logement social
politiques de peuplement
social mixing
interethnic cohabitation
immigration
ethnicity
ethnic groups
socioeconomic groups
social housing
interethnic neighborhood

abstract:
Tant en Europe, qu’en Amérique du Nord, la mixité sociale semble être un outil fréquemment utilisé dans la planification urbaine et le développement de nouveaux quartiers résidentiels où cohabitent maintenant des populations ou des groupes sociaux très différents. Nombreuses sont les études se concentrant sur les quartiers de mixité sociale programmée où règne une diversité des statuts socioéconomiques, mais très peu d’entre elles combinent la cohabitation interethnique dans l’équation.
À Montréal, en 2005, est adoptée la stratégie d’inclusion de logements abordables dans les nouveaux projets résidentiels, donnant ainsi lieu à de nombreux projets résidentiels mixtes au niveau des types de logements. Dans la métropole montréalaise, les opérations de mixité sociale programmée concernent de plus en plus les quartiers de grande diversité ethnique. Il importe alors de comprendre si cette diversité ethnique influence les dynamiques de cohabitation des ménages aux statuts socioéconomiques si différents.
Cette recherche exploratoire vise alors à déterminer si la diversité ethnique est une variable saillante dans les dynamiques de cohabitation d’un projet résidentiel en particulier, celui de la Cité de l’Acadie. Cet ensemble résidentiel semble être le terrain tout indiqué pour une telle étude puisqu’il est composé de trois bâtiments de logements sociaux ainsi que trois bâtiments d’unités d’habitations en copropriété. Nous observons donc les dynamiques de cohabitation interethnique dans un contexte de forte mixité programmée issu de la Stratégie d’inclusion de logements abordables dans les nouveaux projets résidentiels de la ville de Montréal. En fin, la proximité spatiale ainsi que la diversité ethnique ne semblent pas être des facteurs de proximité sociale dans un contexte de grande densité et mixité sociale.

 In Europe and in North America, social mixing appears to be an essential tool in urban planning which orients the development of new residential neighbourhoods where distinct populations or social groups now coexist. In fact, neighbourhoods of great socio-economic diversity have been the focus of many studies, but very few of these studies include the factor of interethnic cohabitation in the equation.
In 2005, the City of Montréal adopted the Strategy for the Inclusion of Affordable Housing in New Residential Projects, which gave place to numerous planned socially-mixed residential projects. In Montréal, planned socially-mixed projects are increasingly built in neighbourhoods of great ethnic diversity. It is thus important to understand if ethnic diversity influences coexistence dynamics amongst households with such divergent socioeconomic status.
This exploratory research aims to determine whether ethnic diversity is a salient variable in regard to cohabitation dynamics of the residential project Cité de l’Acadie, the field of this study. This residential complex strikes us as a good case for such a study since it is composed of three social housing buildings as well as three residential condominiums towers. Therefore, we will be able to observe interethnic cohabitation dynamics in a context of great programmed social mixing resulting from the City’s Strategy for the Inclusion of Affordable Housing in New Residential Projects. In the end, spatial proximity and ethnic diversity do not seem to be factors of social proximity in a context of high density and social mix.


identifier: Bonavia, Aurelio  (1995). Infectability of primary human neural cells by 1-1Utv1AN corona viruses 229E and OC43  Mémoire.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en virologie et immunologie, 191 p.

abstract:
Les coronavirus humains se regroupent en deux souches
sérotypiques, 229E et OC43, et causent des maladies respiratoires(Myint, 1994), gastro-intestinales (Resta et al., 1985), et ont été associés à des myocardites (Riski and Hovi, 1980). Plusieurs observations suggérent que les coronavirus humains pourraient aussi être neurotropes. Des particules coronavirales furent observées dans des échantillons provenant de cerveaux de patients atteints de sclérose en plaques (Tanaka et al .. 1976). Des taux d'anticorps anticoronavirus humains élevés ont aussi été trouvés dans le liquide céphalo-rachidien de patients atteints de sclérose en plaques, ce qui suggère une implication possible de ce virus dans l'étiologie de la maladie (Salmi et al., 1982). Deux souches de coronavirus ont été isolées a partir d'échantillons provenant du cerveau de patient atteints de sclérose en plaques (B urks et al., 1980) et l'inoculation intracérebrale de ces virus à des primates a provoqué une maladie démyélinisante (1\1urray et al.. 1992). En plus, le génome du coronavirus humain 229E (HCV-229E) a été amplifié à partir d'échantillons de patients atteints de sclérose en plaque mais pas de témoins (Stewart et al .. 1992). Ces études sont en accord avec l'hypothèse que les coronavirus humains pourraient être impliqués dans l'étiologie de maladies neurologiques comme la sclérose en plaques. Par contre, le neurotropisme comme tel n' a pas été prouvé jusqu'à date. Des études avec des lignées continues ont démontré que les coronavirus humains peuvent infecter des cellules nerveuses murines et humaines, et que l'infection est productive (Pearson and Mims, 1985; Talbot et al., 1994; Talbot, communication personnelle). Toutefois, ces lignées cellulaires étant immortalisées, il est possible que leur infection ne reflète pas correctement le contexte naturel. Le but du projet de maîtrise était, donc de déterminer l'infectabilité des cellules nerveuses humaines en culture primaire par les coronavirus humains 229E et OC43, une étape importante dans la démonstration du neurotropisme des coronavirus humains, les cultures primaires se rapprochant le plus de la situation in vivo. Pour détecter les :11Higènes vitaux exprimés dans les cellules infectées, nous avons utilisé la méthode d'immunofluorescence indirecte. Pour dé tee ter les antigènes produits par HCV -229E, nous avons utilisé 1 'anticorps monoclonal 5-11 H.6 et un anticorps polyclonal de lapin, les deux dirigés contre 229E. Nous n'avons pas pu détecter la présence d'antigènes viraux, 111 clans les cellules humaines neuronales et astrocytaires foetales, ni clans les microglies, oligodendrocytes ou astrocytes adultes humains. Pour détecter les antigènes d'HCV-OC43, nous avons utilisé 1 'anticorps monoclonal 4-Ell.3 anti-HEV et un anticorps polyclonal cie cobaye anti-OC43. Ce dernier anticorps fut produit expressément pour les expériences présentées ici. Des antigènes de HCV -OC43 ont été détectés dans des cellules humaines astrocytaires foetales, microglies et astrocytes adultes, mais n'ont pas été détectés dans les neurones foetaux m dans les oligodendrocytes. Étant donné les résultats négatifs en immunofluorescence dans le cas de HCV-229E, nous avons utilisé une technique beaucoup plus sensible, le RT -PCR/Southern blotti ng, qui permet de détecter 1 'ARN viral dans des cellules infectées. Avec cette technique, nous avons pu détecter l' ARN de 229E dans des cellules humaines astrocytaires foetales, microglies adultes et dans un mélange d' oligodendrocytes et astrocytes adultes. Les échantillons de neurones étant très difficiles à obtenir, ils n'ont pas pu être testés avec cette technique.
adultes. Nous avons aussi pu détecter par microscopie électronique la présence d'HCV -OC43 dans des astrocytes foetaux infectées en utilisant la méthode des coupes ultra-minces. Nous avons détecté et quantifié les particules virales infectieuses produites après l'infection clés cultures primaires par la méthode d'immunoperoxydase indirecte. Des particules infectieuses d'HCV-229E et d'HCV-OC43 ont ainsi été détectées dans des cultures d'astrocytes foetaux infectés. Également, un taux très bas de particules infectieuses d'HCV-OC4 a été détecté dans les cultures de microglies et d'oligodendrocytes/astrocytes adultes. La différence dans les titres de vus produits pourrait être due à la différence dans la concentration de cellules clans chaque échantillon. Étant donné que nous avons travaillé avec des cultures primaires, nous ne pouvions pas
contrôler ce paramètre. Finalement, nous avons produit cinq hybridomes sécrétant des anticorps monoclonaux an ti-OC43.  Les résultats de ce projet de recherche montrent l'infectabilité de certains types de cellules gliales humaines par les deux souches prototypes du coronavirus humain. La différence clans les degrés d'infectabilité par les deux souches du coronavirus humain n'est pas surprenante car ce phénomène a été montré dans le modèle de souris (Dubois-Dalcq et al., 1982; Gagneten et al., 1995). Le type de cellules qui sont infectables est similaire à celui observé dans l'étude fait avec HCV-OC43 et les cellules nerveuses primaires de souris et clans celui fait avec des cultures primaires foetales humaines (Pearson et !\1ims, 1985). Il est intéressant de constater que les résultats clans le modèle de souris concordent avec les résultats chez l'humain. Par contre, les résultats obtenus en culture primaire ne correspondent pas tout à fait avec ceux en lignées continues où les deux souches virales, 229E et OC43 montrent une haute infectabilité. un grand taux de production virale et où tous les types de cellules nerveuses sont infectables (Talbot, communication personnelle). Même si notre étude présente de l'information plus détaillée dans la caractérisation de 1 'infection des cellules nerveuses humaines par les coronavirus humains, il y encore beaucoup à faire dans le domaine pour comprend re le neurotropisme des corona virus, et faire le lien avec des maladies neurologiques. Finalement, il est intéressant de noter que les coronavirus humains semblent infecter les mêmes types de cellules nerveuses que le virus de l'immunodéficience humaine, soit les astrocytes et les microglies (Sharpless et al., 1992).

 The goal of this project was to determine the infectability of human primary cultured neural cells by human coronaviruses (HCV) 229E and OC43. To detect viral antigens expressed m infected cells we used an indirect immunofluorescence technique. To detect antigens of HCV-229E we used monoclonal antibody 5-IIH.6 and a rabbit polyclonal antiserum, both anti-229E . \Ve could not detect the presence of viral antigens in infected human fetal neurons, fetal astrocytes, adult microglia, adult oligodendrocytes or adult astrocytes. To detect antigens of HCY -OC43 we used monoclonal an ti body 4-E 11.3 anti-HEV and a guinea pig polyclonal antibody to OC43. The latter reagent was produced for these experiments. Viral antigens were detected in infected human ferai astrocytes, a du lt microglia and adult astrocytes but not in fetal neurons and adult oligodendrocytes. Finally, five hybridomas secreting monoclonal antibodies
directed against HCV -OC43 were produced.To verify the negative results obtained with HCV -229E we used a more sensitive technique, RT -PCR/Southern-blotting, to detect viral RNA in infected cells. With this method, we could detect HCV -229E RNA in fetal astrocytes, adult microglia and in a mtx of adult oligodendrocytes and astrocytes. The neuron samples were scarce so we could not test them with this technique. Also, we have detected the presence of HCV-OC43 in infected cells by electron microscopy of ultra-thin sections. We have detected and quantified the infectious particles
produced after infection of the primary cultures using the indirect immunoperoxidase method. Infectious HCV -229E and HCV-OC43 particles were detected in cultures of infected fetal astrocytes. Low amounts of infectious OC43 were also detected in infected adult astrocytes, oligodendrocytes and microglial cultures possible for HCV-229E. We have detected and quantified the infectious particles
produced after infection of the primary cultures using the indirect immunoperoxidase method. Infectious HCV -229E and HCV-OC43 particles were detected in cultures of infected fetal astrocytes. Low amounts of infectious OC43 were also detected in infected adult astrocytes, oligodendrocytes and microglial cultures.


identifier: Rousseau, Andréanne  (2018). Transfert de connaissances au Plan culturel numérique du Québec : synthèse des mémoires et consultations en vue de l’action gouvernementale 2017-2018  Essai.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en pratiques de recherche et action publique, 103 p.

subject: culture numérique

subject: action publique

subject: consultation publique

subject: transfert de connaissances

subject: plan numérique

subject: ministère de la Culture et des Communications

subject: politique culturelle

subject: digital culture

subject: public action

subject: public consultation

subject: knowledge transfer

subject: digital plan

subject: ministry of culture and communications

subject: cultural policy

abstract:
En 2014, le Ministère de la Culture et des Communications (MCC) a agi en tant que précurseur en mettant en place le premier plan d'action pour favoriser le virage numérique en culture : le Plan culturel numérique du Québec (PCNQ). Alors que le fait numérique prend une place grandissante en culture, l’ensemble du ministère – et plus largement, l’ensemble de l’appareil gouvernemental - est appelé à intégrer cette question dans l’élaboration de ses politiques et orientations. En particulier, le renouvellement de la Politique culturelle du Québec, un des dossiers prioritaires du MCC, a fait du numérique l’une des sept thématiques sur lesquelles axer son actualisation. À travers ce processus, une importante démarche de consultation publique a été enclenchée et plus de 400 mémoires ont été déposés par les acteurs du milieu.
Dans ce contexte, une expérience de stage réalisée en 2016 par une étudiante du programme Pratiques de recherche et action publique (PRAP) de l’Institut national de la recherche scientifique (INRS) avait pour objet l’analyse de ces mémoires en vue de l’élaboration stratégique du PCNQ pour les années 2018-2021. L’objectif général était d’accompagner l’équipe du Plan dans l’élaboration des actions à mettre en oeuvre par l’apport de connaissances issues de la recherche.
Le présent essai propose de rendre compte de cet exercice en retraçant les grandes étapes ayant composé le processus du transfert de connaissances dans ce contexte précis. Pour ce faire, les trois premiers chapitres détailleront les composantes centrales du stage, soit le cadre dans lequel il s’insère, les principaux résultats de recherche ainsi que les activités de transfert. Les deux derniers chapitres présenteront quant à eux une réflexion critique sur l’expérience acquise comme agent d’interface au Plan culturel numérique du Québec et, plus largement, sur le rôle du transfert et de la mobilisation des connaissances en milieu gouvernemental.

 In 2014, the Ministry of Culture and Communications (MCC) acted as a forerunner by implementing the first action plan to promote the digital shift in culture: the Plan culturel numérique du Québec (PCNQ). While the digital phenomenon is becoming increasingly important in culture, the entire ministry - and more broadly, the entire government apparatus - is called upon to integrate this issue into the development of its policies and orientations. In particular, the renewal of the cultural policy of Quebec, one of the priority issues of the MCC, have led to a major public consultation in which digital transformations was one of the main challenge. Through this process, more than 400 briefs have been submitted by stakeholders.
In this context, a student from the Research and Public Policy Practices Program (Pratiques de recherche et action publique) of the National Institute for Scientific Research (Institut national de la recherche scientifique) analyzed these memoirs during an internship experience in 2016 in order to work on the setting of the years 2018-2021 of the PCNQ. The general objective was to support the Plan working team by bringing a research-based policy making dynamic in their process.
This essay reports this exercise by tracing the key milestones of the knowledge transfer process in this specific context. To that end, the first three chapters will detail the core components of the internship, namely the framework in which it is inserted, the main research results and the transfer activities. The last two chapters will present a critical reflection on the knowledge brokering experience and on the role of knowledge transfer and mobilization in a governmental context.


identifier: Wiebe, Isabel  (2018). Les pratiques et expériences de mobilité quotidienne des personnes âgées dans l’arrondissement Rosemont–La Petite-Patrie  Thèse.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Thèse de doctorat en études urbaines, 292 p.

subject:
Mobility turn
mobilité
transport
personnes âgées
vieillissement
déprise
accessibilité
aménagement urbain
exclusion
mobility
transport
older adults
aging
déprise
accessibility
urban planning

abstract:
De nombreuses activités quotidiennes des aînés (emplettes, loisirs, etc.) nécessitent des déplacements. Or, la présence d’incapacités physiques a tendance à s’accroître avec l’âge et les aînés sont souvent confrontés à des caractéristiques urbaines contraignantes pouvant gêner ou empêcher l’accès à certains lieux.
Cette thèse examine outre les déplacements dans l’espace et leurs caractéristiques (nombre, longueur, mode de transport, motif, etc.), l’expérience de la mobilité. Elle s’inscrit dans le « mobility turn », un courant de recherche qui s’intéresse aux ancrages dans l’espace qui (re)dirigent les mobilités à différentes échelles spatiales. À l’échelle des villes, certains lieux ou aménagements (bancs, salles d’attente, état des trottoirs) peuvent ainsi influencer l’itinéraire du déplacement des aînés et leur permettre de s’immobiliser (pause, attente, repos) avant de continuer leur route. Ces éléments peuvent considérablement affecter la faisabilité de leur trajet.
La thèse porte également sur les stratégies d’adaptation que les aînés déploient pour répondre à leurs besoins, malgré des difficultés. Ces stratégies comportent une dimension spatiale, par exemple l’abandon de lieux plus lointains au profit des ressources locales, ou encore temporelle, en optant pour un rythme moins fréquent de sorties. Les aînés mobilisent également des personnes (famille, autres proches, etc.) et des ressources matérielles (auto, aide à la mobilité, etc.) pour faciliter ou rendre possible leurs déplacements.
La recherche porte sur des personnes de 70 ans qui se déplacent encore, mais qui peuvent avoir certaines difficultés de déplacement. Les participants à la recherche résident sur le territoire de l’arrondissement Rosemont–La Petite-Patrie (Montréal). La recherche repose sur une diversité de méthodes. Vingt et un aînés ont été équipés d’un traceur GPS (global positioning system) et d’un carnet de déplacements pendant une semaine. Des entretiens ont été réalisés subséquemment auprès de ces mêmes personnes afin de connaître leurs expériences de mobilité et les stratégies qu’elles déploient pour combler leurs besoins.
L’étude montre la capacité d’adaptation des aînés, leurs stratégies autant diversifiées qu’originales, mais aussi les renoncements à des activités. La recherche soulève ainsi des enjeux d’accessibilité aux ressources urbaines contribuant au bien-être des personnes âgées.

 Older adults’ daily activities, such as shopping and leisure, require outdoor mobility. Yet, as a person grows older, physical impairments tend to become more pervasive and older adults often have to face urban constraints which make access to certain places difficult if not impossible.
This thesis examines not only trip patterns (frequency, distance, transportation modes, trip purpose, etc.), but also the mobility experience itself. It adheres to the « mobility turn », an approach which examines spatial moorings that configure and enable mobilities at different spatial scales. Urban characteristics or amenities such as benches, waiting areas with adequate seating and sidewalk maintenance, may influence the itineraries of older adults, and allow for moments of rest and stillness during their journey. These elements may have a positive impact on the feasibility of the trip.
This thesis also addresses adaptation strategies used by older adults to meet their needs in spite of constraints. These strategies have a spatial dimension, for instance choosing local providers rather than travelling to more distant places, or a temporal dimension, for example making fewer trips. Moreover, older adults mobilize human resources (family, friends, etc.) and material resources (cars, mobility aids, etc.) to facilitate or make possible outdoor mobility.
The study participants live in the Rosemont–La Petite-Patrie borough in Montreal and are aged 70 and over. They still perform out-of-home activities but may have some mobility impairments. The study is based on several methods. Twenty-one older adults were equipped with a GPS (global positioning system) monitor and a travel diary for a one-week period. Subsequently, semi-structured interviews were conducted with these same persons regarding their mobility experiences and the strategies used to meet their needs.
The study reveals older adults’ capacity for adaptation, the diversified and original strategies employed, but also the fact that they renounce activities. It also reveals how accessibility to urban resources may contribute to the well-being of the elderly.


identifier: Zahar, Hela  (2018). Le calligraffiti arabe dans la culture visuelle contemporaine : tensions urbaines et circulation des images  Thèse.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Doctorat en études urbaines, 621 p.

subject: calligraffiti arabe

subject: scène visuelle locale

subject: translocale et numérique

subject: art urbain

subject: régimes de visibilité

subject: pratiques de l’image physique et numérique

subject: culture visuelle

subject: enjeu

subject: politique

subject: tensions arabo-occidentales

subject: remix

subject: circulation et agrégation

subject: Arabic calligraffiti

subject: local

subject: translocal and digital visual scenes

subject: urban art

subject: regimes of

subject: visibility

subject: physical and digital visual practices

subject: visual culture

subject: political aspects

subject: Arab-Western

subject: tensions

subject: remix

subject: distribution

subject: aggregation

abstract:
La thèse porte sur les enjeux politiques de la culture visuelle contemporaine en prenant pour objet
spécifique le calligraffiti arabe, une forme d’art urbain qui s’inspire à la fois du graffiti et de la
calligraphie arabe. En se propageant dans l’espace public des villes arabes et occidentales, telles
Montréal, Paris et certaines villes de la Tunisie, le calligraffiti arabe soulève un certain nombre de
tensions inhérentes à sa mise en visibilité. Cet enjeu révèle une forme d’art urbain porteuse de
différents conflits, rapports de force et pouvoirs, que ce soit les tensions arabo-occidentales dans
la culture visuelle des villes occidentales, celles reliées au rôle religieux de la calligraphie
islamique dans la culture visuelle des villes arabes, celles reliées à l’art urbain dans l’ensemble de
ces villes ou encore celles qui sont circulées dans les différents lieux numériques où les images
de ses oeuvres se manifestent.
Pour cerner cet enjeu, la thèse développe un cadre d’analyse qui repose sur trois ensembles
d’éléments théoriques. Le premier ensemble définit et applique les concepts d’espaces, de lieux et
de régimes à l’analyse de la visibilité dans les espaces publics physiques et numériques. Le
deuxième ensemble de concepts décrit l’art urbain, dont le calligraffiti arabe, comme un
assemblage de pratiques de l’image (remix, circulation, agrégation) à l’intérieur de ces espaces et
régimes de visibilité. Le troisième ensemble introduit et utilise le concept de scène visuelle pour
illustrer la mise en visibilité du calligraffiti arabe à l’intérieur des systèmes d’articulation de la
scène visuelle locale, translocale et numérique de l’art urbain. Le calligraffiti arabe « travaille »
politiquement les régimes de visibilité dans lesquels il s'exprime et les amène à se transformer.
En retour, les régimes de visibilité « travaillent » le calligraffiti arabe qui se transforme à son tour
pour s'adapter aux pressions politiques des régimes de visibilité. Il constitue ainsi une forme de
réappropriation culturelle (arabe) d'un art urbain mondialisé d'origine occidentale (le graffiti newyorkais),
une hybridation typique de la culture du remix où ce « dialogisme du script » participe
activement à la culture visuelle, à son hétérogénéité et aux enjeux de la visibilité publique de l'art
urbain.
Dans le contexte des tensions qu’il soulève dans l’espace public, cette mise en visibilité du
calligraffiti arabe devient proprement problématique et l’hypothèse d’une modulation de ses
pratiques est avancée pour expliquer sa participation et sa contribution à la scène visuelle de l’art urbain. Pour vérifier cette hypothèse, la thèse suit le développement de cette forme d’art urbain
depuis son émergence dans des entrepôts abandonnés de Montréal en 2008 jusqu’à ses
manifestations les plus récentes dans plusieurs villes arabes et occidentales. Une étude
ethnographique physique et numérique des événements de calligraffiti arabe est effectuée sur une
période de dix ans (2008-2017). Ces événements se déroulent principalement sur trois terrains, à
Montréal, en Tunisie et à Paris et se succèdent chronologiquement, mais toujours de manière
complexe au cours de quatre segments principaux. Chaque segment illustre une étape importante
de son développement et se constitue de plusieurs événements représentant la réalisation d'une ou
de plusieurs oeuvres de calligraffiti arabe. Le dernier segment illustre la fragmentation
géographique du calligraffiti arabe au gré de l’exacerbation des tensions arabo-occidentales post-
Charlie Hebdo. Au cours de ce dernier segment, le calligraffiti arabe se retrouve à Paris, Montréal
et en Tunisie, mais également en d’autres lieux comme l’Égypte, la péninsule arabique, les États-
Unis et l’Australie.
L’étude ethnographique de ces quatre segments permet de caractériser les différents régimes de
visibilité impliqués, d’identifier les acteurs importants, de décrire les pratiques physiques et
numériques de l’image et de révéler les différents systèmes d’articulation impliqués dans la mise
en visibilité du calligraffiti arabe. Une synthèse et discussion des résultats est présentée quant à
l’enjeu de la visibilité du calligraffiti arabe, la modulation de ses pratiques et les caractéristiques
de sa mise en scène visuelle. La contribution de la thèse est à la fois théorique et ethnographique.
Le cadre d’analyse proposé permet de mieux comprendre l’enjeu politique du calligraffiti arabe et
l’étude ethnographique enrichit et précise ce cadre d’analyse tout en ouvrant la voie à de
nouvelles méthodes d’analyse visuelle. L’objectif est d’apporter une démonstration
complémentaire tant conceptuelle qu’ethnographique de l’ambiguïté que pose à la fois
l’effervescence d’une scène visuelle locale, translocale et numérique et de sa mise en visibilité de
tensions arabo-occidentales.

The topic of this thesis is the political implications of the contemporary visual culture of Arabic
calligraffiti, a form of urban art that is inspired both by graffiti and Arabic calligraphy.
Calligraffiti has spread in both Arab and Western cities, including Montreal, Paris and certain
Tunisian cities. Its visibility underlines inherent tensions in the art form. Calligraffiti explores
various conflicts and power relations, such as Arab-Western tensions in the visual culture of
Western cities, tensions around the religious role of Islamic calligraphy in Arab cities, tensions
around urban art in all cities, and around the various digital spaces where these works are
disseminated.
To examine these questions, this thesis employs an analytical framework based on three groups
of concepts. The first group defines and applies concepts of space, place and regimes to analyze
visibility in physical and virtual public realms. The second group of concepts describes urban art,
including Arabic calligraffiti, as a blending of visual practices (remix, distribution, aggregation)
within these spaces and regimes of visibility. The third group introduces the concept of the visual
scene to illustrate the visibility of Arabic calligraffiti within the systems of articulation of local,
translocal and digital visual scenes. Arabic caligraffiti politically « reworks » the regimes of
visibility in which it evolves, and in turn transforms these regimes. Concurrently, these regimes
of visibility « rework » Arabic calligraffiti, which is also transformed to adapt to the political
pressures of the regimes. As such, calligraffiti becomes an Arab form of cultural appropriation of
a globalized urban art form of Western origin (New York graffiti), a hybrid typical of remix
culture where the « dialogism of the script » actively participates in visual culture, its
heterogeneity, and the public visibility of urban art.
In this study, we advance the hypothesis that there is a modulation of practices that explain its
participation and contribution to the visual scene of urban art. To test this hypothesis, this thesis
follows the development of calligraffiti since its appearance in abandoned warehouses in
Montreal in 2008 to its most recent appearance in several Western and Arab cities. From 2008 to
2017, we conducted a digital and physical ethnography in three locations, Montreal, Tunisia and
Paris. This fieldwork followed a complex chronology containing four main stages. Each stage
illustrates an important step of the development of calligraffiti and consists of one or more specific artworks. The final stage illustrates the geographical fragmentation of calligraffiti, with
the exacerbation of Arab-Western tensions after the Charlie Hebdo incident in Paris. During this
final stage, calligraffiti expanded beyond Paris, Montreal and Tunisia, appearing in other
locations including Egypt, the Arabian Peninsula, the United States and Australia.
Ethnographic study of these four segments allowed me to define various regimes of visibility, to
identify key actors, to describe the physical and digital visual practices, and to reveal the different
systems of articulation implied in the visibility of Arabic calligraffiti. My results include a
summary and discussion of the visibility of Arabic calligraffiti, the modulation of practices and
the characteristics of its visual mise en scène. The scholarly contribution of this thesis is both
theoretical and ethnographic. My analytical framework allows us to better understand the
political implications of Arabic calligraffiti. My ethnographic study broadens and clarifies this
framework, introducing new methods of visual analysis. My objective is to conceptually and
ethnographically explore the ambiguity created both by the effervescence of local, translocal and
digital visual scenes and by the visibility of Arab-Western tensions.


identifier: Beauchamp, Anne-Marie  (2018). L’indice Mustang : géologie et altération d’une minéralisation aurifère mise en place dans les turbidites de la ceinture de la Basse-Eastmain, Eeyou Itschee Baie-James.  Mémoire.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en sciences de la terre, 360 p.

subject:
or
aurifère
Eeyou Istchee Baie-James
orogénique
veine
Mustang
turbidite
wacke
archéen
Province du Supérieur
arsénopyrite

abstract:
L’indice aurifère Mustang, une veine de quartz ± carbonate, se trouve sur la propriété Wabamisk appartenant à la Minière Osisko. L’indice est localisé près du contact entre les Sous-provinces de La Grande et de Némiscau, à 65 km au SSO de la mine Éléonore. La zone aurifère est exposée en surface, suivie latéralement en forage sur une distance de 570 mètres et jusqu’à 250 mètres en profondeur. Son épaisseur varie de quelques centimètres à 1,5 mètres. Les teneurs aurifères varient de quelques grammes par tonne jusqu’à 275 g/t. L’indice Mustang est encaissé dans une séquence de roches sédimentaires archéennes turbiditiques (<2709 ± 4 Ma) au faciès des schistes verts supérieurs. La séquence sédimentaire a subit au moins trois phases de déformation ductile suivies d’un épisode de déformation fragile tardive (D₄). Une première phase de plissement d’orientation NNO s’exprime par des plis P₁ replissés par des plis P₂ orientés ENE. La foliation principale S₂ est de direction ENE et parallèlle aux plans axiaux P₂. La phase de déformation D₃ est caractérisée par un clivage de crénulation SO à pendage modéré vers le nord.
La veine Mustang est subparallèle au litage et plissée en S. Elle s’est mise en place durant la déformation régionale D₂, le long d’un flanc de pli anticlinal P₂ déversé vers le sud. Sur plus de 300 mètres latéralement, la veine Mustang s’est injectée le long d’un dyke de mélano-gabbro riche en magnésium. Ce dernier, qui présente plusieurs caractéristiques des lamprophyres shoshonitiques, a engendré un fort contraste rhéologique dans la séquence sédimentaire, ce qui semble avoir favorisé le développement d’une zone de déformation, facilitant ainsi la migration du fluide hydrothermale aurifère.
Les veines aurifères du secteur de l’indice Mustang et leurs épontes proximales altérées (sodique-calcique, potassique, calco-silicatée et carbonatisation) contiennent de 1 à 10% d’arsénopyrite, de pyrrhotite, et des traces de pyrite, de chalcopyrite, de galène et de sphalérite. L’or est présent selon plusieurs habitus et sa distribution est bimodale. L’or visible est libre dans les veines de quartz ± carbonate, sous forme d’inclusions, et en association spatiale avec les sulfures; principalement l’arsénopyrite (Asp-a) et la pyrite
(Py-b et Py-c). L’or invisible se retrouve surtout dans la structure cristalline de l’arsénopyrite idiomophe tardive (Asp-b) et dans la marcassite. Le modèle génétique des gisements d’or métamorphisé s’applique très bien aux minéralisations du secteur. Les textures observées en lame mince indiquent que les Asp-a ont cristallisé lors de la phase de déformation régionale principale et qu’elles sont génétiquement et spatialement liées à l’injection d’un fluide hydrothermal. Lors d’une augmentation de la température, l’or dans la matrice de l’Asp-a a été extrait et remobilisé sous la forme d’inclusions et de particules colloïdale dans les Asp-a, et à l’extérieur de celles-ci. L’or dans les bordures limpides de l’Asp-b proviendrait majoritairement d’une remobilisation post-D2, près du pic du métamorphisme régional. L’or qui se met en place tardivement dans l’histoire tectono-métamorphique est une caractéristique des gisements d’or orogénique.
L’indice Mustang présente des analogies en termes de contexte géologique, de styles de minéralisation, d’altération et de déformation avec les gisements syn-déformation encaissés dans des séquences de turbidites (ex. Meguma en Nouvelle-Écosse et Central Victoria en Australie). Tout comme la mine Éléonore, l’indice Mustang illustre le potentiel aurifère des assemblages archéens métasédimentaires plissés. Le contact tectono-métamorphique entre les Sous-province de La Grande et d’Opinaca/Némiscau représente un métallotecte de permier ordre pour les minéralisations aurifères dans la région Eeyou Itschee Baie-James.


identifier: Makungu, Landrie Anaelle Joana  (2018). Comparaison des coûts de diverses mesures d'adaptation des réseaux de drainage urbain.  Mémoire.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Maîtrise en sciences de l'eau, 86 p.

subject:
eau pluviale
conduites
changement de diamètre
contrôle à la source
surcharges
coût
pratiques de gestion optimale

abstract:
Il existe principalement deux manières de gérer l’eau pluviale pour limiter les inondations
causées par des débordements de conduites en milieu urbain. La première consiste à
changer le diamètre d’une ou d’un ensemble de conduites afin d’accroître la capacité de
transport du réseau et donc de réduire la fréquence des surcharges et des débordements.
La seconde, nommée contrôle à la source, consiste à réduire la quantité d’eau collectée,
ce qui peut être réalisé en ajoutant sur les divers sous-bassins des structures favorisant
l’infiltration et/ou l’évapotranspiration de l’eau ruisselée.
Les études comparatives de ces deux types de gestion sont nombreuses, cependant, peu
d’entre elles s’intéressent aux différences de coûts. Afin d’explorer cet axe, nous avons
émis l’hypothèse selon laquelle la méthode dite durable, faisant appel au contrôle à la
source, peut s’avérer moins coûteuse que celle nécessitant un agrandissement des
conduites. L’objectif principal du mémoire est de vérifier cette hypothèse.
Cet objectif a été vérifié sur un cas d’étude, qui est un réseau urbain réel drainant une
superficie de 260 ha, en utilisant six pluies réelles, ayant des périodes de retour entre 2 et
5 ans. Ainsi, nous avons réalisé différentes simulations à l’aide du logiciel PCSWMM
version7, afin de pouvoir, dans l’ordre :
- Énumérer les noeuds en surcharge et leur position;
- Appliquer un algorithme qui permet d’établir les conduites responsables de la
surcharge et augmenter leur diamètre pour l’application du scénario
d’agrandissement;
- Identifier les sous-bassins où il est rentable d’installer des cellules de biorétention
pour l’application du scénario avec pratiques de gestions optimales (PGO).
Pour ce cas d’étude, l’hypothèse a été validée, c’est-à-dire que, pour une même
performance hydraulique, le scénario avec PGO s’est avéré moins coûteux que le
scénario de remplacement de conduites, soit trois fois moins cher au minimum.
Néanmoins, nous avons pu constater que, sur un réseau réel, l’ajout de PGO doit aussi
s’accompagner d’ajustements structuraux sur certaines conduites.


identifier: Larios, Araceli Dalila  (2018). Étude sur la performance de l’échantillonnage à flux passif pour estimer les émissions d’oxyde nitreux dans les bâtiments d’élevage.  Thèse.  Québec, Université du Québec, Institut national de la recherche scientifique, Doctorat en sciences de l'eau, 157 p.

subject:
gaz à effet de serre
émissions d'oxyde nitreux
échantillonnage à flux passif
adsorption
élevage animal
greenhouse gases
nitrous oxide emissions
passive flux sampling
adsorption
livestock emission sources

abstract:
Le secteur de l'élevage animal représente une source importante d'émission de gaz à effet de serre (GES) dans le monde. Une augmentation de 70% des activités mondiales d’élevage est prévue d'ici 2050. En 2014, il a été estimé que le secteur de l’élevage a produit 3,47 Gt en équivalent de CO₂, avec en tête de liste le méthane (CH₄) représentant 43%, suivi de l'oxyde nitreux (N₂O) avec 21%. Actuellement, les producteurs et les scientifiques sont confrontés à de grandes difficultés pour estimer les émissions réelles de GES provenant du secteur de l'élevage, car la plupart des méthodologies disponibles pour la mesure des émissions de GES sont complexes et coûteuses. De plus, les émissions de GES dans ce secteur varient en fonction des conditions météorologiques, du milieu de vie des animaux, ainsi que de leur stade physiologique. Cette variabilité n'est pas prise en compte dans l'estimation des facteurs d'émission utilisés pour intégrer les inventaires locaux et mondiaux.
L'échantillonnage à flux passif (éFP) est une technique utilisée avec succès pour échantillonner et estimer les émissions de gaz tel que l’ammoniac (NH₃) provenant de sources agricoles. Cette technique est peu dispendieuse et peu exigeante du point de vue opérationnel. Cependant, celle-ci n'a pas été évaluée pour l’estimation des pertes de GES. Par conséquent, l'objectif de cette thèse a été l'adaptation et l'étude de la performance d’échantillonnage à flux passif pour estimer les émissions du N₂O dans les bâtiments d'élevage animal. Quatre étapes sont expliquées au cours de ce document : en premier, la conception et l'évaluation de l'échantillonneurs à flux passif (éFP); ensuite l'évaluation du comportement d'adsorption et de désorption de la zéolithe 5A; suivit par la conception la validation d’une méthodologie de l’éFP adaptée à l’estimation des émissions de N₂O dans les conditions d’opération et l’environnement des bâtiments d’élevage; ainsi que l'analyse de faisabilité de la méthodologie. Les résultats ont démontré que la meilleure configuration des ÉFP est celle utilisant une plaque à orifice de 0,7 mm d’ouverture et une épaisseur de lit d'adsorbant de 20-50 mm, avec des adsorbants sphériques. L’adsorption du N₂O par la zéolithe 5A dans l’ÉFP variait en fonction de la concentration en N₂O provenant de la source, de la masse et de l’épaisseur du lit d'adsorbant. À l'échelle d’une ferme expérimentale, l’éFP a montré une bonne exactitude (88%) et précision (95%) dans un temps d'échantillonnage de 1,5 h en utilisant un nouveau prototype d’ÉFP. Cependant, à l'échelle commerciale l'éFP devra être optimisée notamment en améliorant la sélectivité du lit d'adsorbant, car un temps de percée d’environ 8 minutes a été observé dans deux bâtiments d'élevage animal.

Livestock sector is a significant greenhouse gas (GHGs) emission source and it is projected to grow around the world by 70% by 2050. In 2014, it was estimated that 3.47 Gt CO₂-eq was released from this sector, being methane (CH₄) the gas with the highest contribution (43%), followed by nitrous oxide (N₂O) with a 21%. Currently, producers and scientists face challenges to estimate real GHG emissions from the livestock sector because most of the methodologies used are complex, expensive and present spatial and temporal variations among sources. This variability is not considered in the estimation of emission factors used to integrate local and global inventories.
Passive flux sampling is a technique successfully used to sample and estimate ammonia (NH₃) emissions from agricultural sources. This technique encompasses low operational and capital investment requirements to quantify gas emissions. However, it has not been evaluated to estimate GHGs. In this context, the objective of this thesis was the study of parameters determining the performance of passive flux sampling for the estimation of N₂O from livestock buildings. The study included: the design and evaluation of passive flux samplers (PFS) based on adsorption, the evaluation of adsorption and desorption behaviour of adsorbents used as collector medium, the validation of PFS in experimental and commercial farms and the analysis of the feasibility of the methodology. Results showed that the best configuration was a 0.7 mm orifice plate and an adsorbent bed thickness from 20 to 50 mm using spherical zeolites 5A particles. The mass of N₂O collected on the zeolite was a function of inlet N₂O concentration, the length of the adsorbent bed, and co-adsorption of other compounds. After collection of samples, the N₂O can be desorbed easily of the zeolite 5A at efficiency from 94 to 97%. The validation at the experimental and field level has shown that passive flow sampling is a potential technique to be used to estimate GHG emissions. However, it is suggested to increase the selectivity of the adsorbent bed in order to adequately estimate GHG emissions.